1995-2001 清华大学计算机科学与技术系讲师、副教授
2001-现在 清华大学软件学院 副教授、教授
2017年12月14日，中国互联网协会标准工作委员会成立大会在北京召开，王建民任中国互联网协会标准工作委员会副主任委员。
学术兼职
国家支撑计划制造业信息化科技工程专家组 成员
国家863计划先进制造技术领域专家组 成员
国家重大科技专项“核高基”基础软件方向实施专家组 成员
中国计算机学会 数据库专委会 委员
Petri网专委会 委员
研究领域
数据管理与信息系统，云环境非结构化数据管理技术、业务过程与产品生命周期管理、数字版权与系统安全技术、数据库测试技术。